SCIEX和Illumina 共同研發整合蛋白質組學（xué）和基因組（zǔ）學

近，美國的三個研發機構發布了分（fèn）析（xī）和比較（jiào）蛋白質組學和基因組學數據的新應用，這些應用方法是OneOmics項目的一部分。OneOmics是Illumina和SCIEX的合（hé）作項目。

為了消除不同組學之間（jiān）的信（xìn）息壁壘，OneOmics項目將SCIEX基（jī）於新一代蛋（dàn）白質組學 的SWATH 采集係統和Illumina公司基於BaseSpace雲計算的新一代測（cè）序數據相結合。Advaita Bioinformatics注：最小（xiǎo）抗拉強度值不是鏈條的工作載荷公司、係統生物學研究所和耶魯大（dà）學的（de）研究人員也在采用SWATH蛋白質組學（xué）數據（jù）開發雲技術對與國內實（shí）驗機廠家來講的（de）應（yīng）用（yòng）程序和數據（jù）庫。

係統生物學研究所副教授Rob Moritz帶領團隊開發了SWATHAtlas Ion Library Gen"飛機減重能夠節省燃料本錢erator應用程序，它提供了快捷（jié）進入（rù）ISB數據庫（kù）的方法，為具有（yǒu）SWATH采集係統（tǒng）的NGP服務。目前，ISB數據庫已經包括了人、酵母和結核杆菌蛋白質組數（shù）據庫。我們（men）很高興成為SCIEX和Illumina合作（zuò）項目的一部（bù）分， Moritz說，ISB和整個學術界開發的這些應用程序提供了一個強大的解決方案，這不僅給蛋白質組（zǔ）學研究道路帶來很大影響，而且將（jiāng）會建成係統生物學數據（jù）係統。

Advaita公司為BaseSpace平台研發了iPathwayGuide分析包。該應用分（fèn）析包可以用作生化途徑分析、GO分（fèn）析、miRNA預測、藥物和疾病分（fèn）析。它簡化了從（cóng）整合蛋白質組學、轉錄組學數據庫尋找生物數據（jù）的過程，並將（jiāng）有助於推（tuī）進生物標誌物的發現和疾病研究（jiū）。

耶魯大學的Chris Colangelo和Rob Kitchen共同（tóng）為BaseSpace平台開（kāi）發了RNASeq應用程（chéng）序。這個應用程序能將一個Illumina的RNASeq實驗數（shù）據轉換為一種蛋白質數據（jù）組，得到（dào）的數據可以為建立SCIEX SWATHTM采集（jí）係統數（shù）據庫。因此，它是一個（gè）更有針對性的蛋白質組學（xué）分析方（fāng）法，這對某特殊疾病的遺傳學（xué）研究者來說非常有用。這一係（xì）列工（gōng）作流程是係統生物學研究的普通需求，但直到現在隻有少數專業的實驗室能滿足這些複雜的生（shēng）物信息學條款。

SWATHTM采（cǎi）集係統使研究人員能夠準確、多次的從成（chéng）百的樣品中定量數以千計的蛋白質，從而得到在不同環境刺激（jī）下蛋白質組的變化等非常有意義的結論。 SCIEX公（gōng）司的理論與臨（lín）床研究業（yè）務總（zǒng）監 Aaron Hudson說，下一步是將得到的這些（xiē）蛋白質組學（xué）的結論與基因（yīn）組學和轉錄組學等其他組學的結論（lùn）整合在一起。此項目的三家合作機構ISB、耶魯大學和Advaita Bioinformatics公司（sī）都（dōu）推出（chū）了免費的應用程序，這些應（yīng）用程序對此工作方法的深（shēn）入實驗室很（hěn）有幫（bāng）助（zhù），同時也鋪設了通（tōng）向橫跨生命科學中兩大領域的標準化數據分析的道路。

編譯：郭浩楠